Selain menggunakan Kurikulum 2013, SD PUTRA 1 juga menerapkan tiga metode pembelajaran yaitu Montessori, Active Learning, dan Inqury. Dengan menggunakan ketiga model itu pembelajaran dirancang agar peserta didik percaya diri melaksanakan eksperimen secara mandiri sehingga pengalaman peserta didik tentang ilmu pengetahuan bisa semakin luas. Hal tersebut bisa mendorong rasa penasaran peserta didik untuk mengutarakan pertanyaan dan mencari jawaban sendiri.